Хоч події Zombie Overkill 3D і розвиваються в наступному столітті, але знайти управу на розбурханий вірус, що перетворює людей в кровожерних зомбі, люди не змогли. Хвороба швидко переросла в світову епідемію з закономірним результатом - залишки не зараженого людства насилу бореться за своє життя проти наступаючих орд безмозкого противника. А ось останній починає подавати ознаки розуму і все з більшою вигадкою підходить до питання вилучення свіжого м'яса з, поки ще, неприступних притулків. Головному герою необхідно дістатися до однієї з подібних укріплених зон, щоб віддихатися після багатьох днів боїв і прийняти рішення, що ж робити далі. Проблема в тому, що кадаври дуже чіпко "сіли на хвіст" і не дають жодного шансу від них відірватися. Доведеться дати вирішальний бій за підсумками якого стане ясно, приєднатися чи персонаж до постапокаліптичному легіону чи ні.